加工中心坐標(biāo)系統(tǒng)包括機(jī)床坐標(biāo)系和工件坐標(biāo)系，不同的加工中心其坐標(biāo)系統(tǒng)略有不同。如前所述，機(jī)床坐標(biāo)系各坐標(biāo)軸的關(guān)系符合右手笛卡兒坐標(biāo)系準(zhǔn)則。 

機(jī)床坐標(biāo)系是用來確定工件坐標(biāo)系的基本坐標(biāo)系；是機(jī)床本身所固有的坐標(biāo)系；是機(jī)床生產(chǎn)廠家設(shè)計(jì)時(shí)自定的，其位置由機(jī)械擋塊決定，不能隨意改變。該坐標(biāo)系的位置必須在開機(jī)后，通過手動(dòng)回參考點(diǎn)的操作建立。機(jī)床在手動(dòng)返回參考點(diǎn)時(shí)，返回參考點(diǎn)的操作是按各軸分別進(jìn)行的，各軸沿正向返回極限位置。當(dāng)某一坐標(biāo)軸返回參考點(diǎn)后，該軸的參考點(diǎn)指示燈亮，同時(shí)該軸的坐標(biāo)值也被清零。 

機(jī)床坐標(biāo)系原點(diǎn)也稱機(jī)械原點(diǎn)、參考點(diǎn)或零點(diǎn)。通常所說的回零、回參考點(diǎn)，就是直線坐標(biāo)或旋轉(zhuǎn)坐標(biāo)回到機(jī)床坐標(biāo)系原點(diǎn)。那么機(jī)床坐標(biāo)系原點(diǎn)究竟在什么位置呢?機(jī)床坐標(biāo)系原點(diǎn)是三維面的交點(diǎn)。不像各坐標(biāo)系回零一樣可以直接感覺和測(cè)量，只有通過坐標(biāo)軸的零點(diǎn)作相應(yīng)的切面，這些切面的交點(diǎn)即為機(jī)床坐標(biāo)系的原點(diǎn)。